La ayuda principal para encontrar a los Archivos Nazarenos es un sistema de inventarios o listas que identifican y describen artículos en las colecciones. El inventario también da la ubicación de los estantes de los artículos. Las colecciones y sus inventarios están organizados de acuerdo con catorce categorías, divididas a su vez en «grupos de registros». Las catorce categorías están numeradas de 100 a 1400. A cada grupo de registros se le asigna su propio número dentro de la categoría (101, 102, 103, etc.). Si las colecciones bajo un grupo de registros en particular son grandes o complejas, pueden subdividirse.
Los inventarios y colecciones de los Archivos Nazarenos cambian con cada día de trabajo y con cada nueva adquisición. El inventario más completo y preciso es siempre la «copia de trabajo» en la sala de trabajo del archivo. La copia de trabajo contiene adiciones frecuentes escritas a mano, muchos inventarios no tipificados y listas de colecciones no procesadas. Un investigador puede obtener acceso a porciones del inventario de trabajo poniéndose en contacto con el administrador de Archivos.